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Proyectos

Proyectos de impacto y desarrollo tecnológico planificados, desarrollados e implementados con éxito por bioalgoritmia.

|Logo de CONABIO |
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (en proceso)

La CONABIO es una comisión intersecretarial integrada por 10 secretarías del gobierno de México con la misión de promover, coordinar, apoyar y realizar actividades dirigidas al conocimiento de la diversidad biológica, así como a su conservación y uso sustentable para beneficio de la sociedad. Bioalgoritmia fue elegida como consultora para el diseño y desarrollo de software del sistema de monitoreo, evaluación y aprendizaje participativo (MEAP) del proyecto AgroecoBio-Mx, que fomenta la integración de la biodiversidad en actividades productivas rurales de México, con colaboración de la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural, la CONABIO y la Agencia Francesa de Desarrollo (AFD).

|Imágen de mapa de la ciudad con los contenedores marcados |
Gobierno municipal de Villaflores, Chiapas, México

La gestión de residuos es un problema complejo que presenta múltiples retos a lo largo de su ciclo. Con el fin de optimizar la primera etapa (recolección) y como parte de un plan integral, bioalgoritmia gestionó la geolocalización de cada contenedor de la ciudad para luego aplicar algoritmos de aprendizaje de máquina no supervizados con criterios de proximidad espacial, calculando finalmente una propuesta de ruta óptima de recolección para cada grupo considerando la ubicación del depósito sanitario mediante algoritmos con metaheurísticas. Como resultado, cada contenedor es atendido minimizando la distancia recorrida por cada camión de recolección.


Congresos y ponencias

Participaciones en congresos de alto nivel, conferencias académicas y en espacios de divulgación.

Conferencia internacional de filosofía de la computación 2025

Fotografía de Salvador en el evento

Este evento académico de cinco días (27-31 de octubre 2025) está dedicado a promover la investigación de vanguardia en la intersección entre la computación y la filosofía —un diálogo que nunca ha sido más urgente. En una época marcada por la rápida transformación tecnológica, los desafíos éticos de la inteligencia artificial y el creciente impacto de los sistemas computacionales en todos los aspectos de la sociedad, existe una necesidad apremiante de contar con espacios de reflexión crítica y debate riguroso. A medida que la computación redefine nuestras instituciones, economías, modos de investigación e incluso nuestra comprensión del conocimiento y de la existencia, esta conferencia busca fomentar un compromiso interdisciplinario profundo con las implicaciones y responsabilidades filosóficas de la vida en la era digital.

Salvador Garcilita, fundador de bioalgoritmia, presentó una conferencia sobre transición dual para la sesión "Computación, sociedad y futuros alternativos", en la cual se exploraron las motivaciones, desafíos y oportunidades de integrar tecnologías digitales, cómputo y algoritmos de frontera en los esfuerzos por abordar los problemas de la crisis socioambiental actual, buscando integrar la transformación digital y la verde en una sola; una transición dual.

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Conferencia mexicana en reconocimiento de patrones 2025

Programa del día de las conferencias que se presentaron

La Conferencia Mexicana sobre Reconocimiento de Patrones (MCPR, por sus siglas en inglés) es un evento académico anual que reúne a investigadores, profesionales y estudiantes de México y de todo el mundo, interesados en el reconocimiento de patrones y áreas afines. Cubre diversas áreas relacionadas con el reconocimiento de patrones, incluyendo la visión por computadora, el aprendizaje automático, las redes neuronales, el procesamiento de imágenes y el análisis de datos. Es organizada por instituciones académicas mexicanas, en colaboración con el Instituto Nacional de Astrofísica, Óptica y Electrónica (INAOE), la Asociación Internacional para el Reconocimiento de Patrones (IAPR) y la Asociación Mexicana de Visión por Computadora, Neurocomputación y Robótica (MACVNR), siendo internacionalmente reconocida como una conferencia de alta calidad.

En la edición 2025, realizada en el Centro de Investigación en Matemáticas (CIMAT) en Guanajuato, México, Salvador Garcilita (fundador) y Edgar Román (investigador asociado) presentaron el trabajo 'Determining Optimal Population Management With Reinforcement Learning', el cual contribuyó a la temática 'aprendizaje por refuerzo' e inteligencia artificial, y explora el uso de estas técnicas para simular escenarios relevantes en ecología y sustentar la toma de decisiones.

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Foro regional de transformación digital 2023

La Secretaría de Economía y la Agencia Alemana de Cooperación para el Desarrollo Sustentable (GIZ por sus siglas en alemán) realizaron el Foro Regional de Transformación Digital en mayo 2023, el cual se orientó a la creación de un espacio de colaboración para vincular a diversos actores del ecosistema digital y de innovación, y conocer soluciones innovadoras que enfaticen el valor de la transformación digital en beneficio de la sociedad, economía y del medio ambiente en la región Latinoamericana. El evento contó con la participación de casi 6 mil personas de cinco países de Latinoamérica pertenecientes a los sectores públicos, privados, academia y sociedad civil.

Durante el evento, Salvador Garcilita, fundador de bioalgoritmia y entonces asesor en la GIZ, presentó la conferencia "transformación digital por la biodiversidad" en el auditorio de la Secretaría de Economía, en la cual destacó las oportunidades de trabajo interdisciplinario entre Biología, computación y otras áreas del conocimiento, con un énfasis en su aplicación en proyectos de cooperación que buscan mayor impacto en temas ambientales.

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Publicaciones

Artículos de investigación, reportes técnicos y documentos de divulgación publicados por científicos asociados a bioalgoritmia.

Portada del trabajo
Transformación digital, acceso y uso integrado de información: recomendaciones para el impulso y la modernización sostenible de la agricultura.

Resumen:

El documento analiza la transformación digital en el sector agropecuario mexicano, enfatizando su relevancia para mejorar la sostenibilidad, la resiliencia climática y la eficiencia institucional en zonas rurales. Dividido en dos apartados, el primero aborda conceptos clave de digitalización, brechas digitales, estrategias regionales y herramientas digitales disponibles, mientras que el segundo explora tecnologías específicas como inteligencia artificial, Internet de las cosas, blockchain, cómputo en la nube y desarrollo de software aplicado a la agricultura. Asimismo, se presentan recomendaciones para la implementación de soluciones digitales que faciliten el acceso a la información, promuevan la inclusión social y fortalezcan la integración de los sistemas de información en la producción y comercialización agropecuaria.

  • Cita: Núñez-Ramírez, R., Garcilita-Arguello, S. (2025). Transformación digital, acceso y uso integrado de información Recomendaciones para el impulso y la modernización sostenible de la agricultura. Deutsche Gesellschaft für Internationale Zusammenarbeit (GIZ) GmbH.
Gráfica presentada en el artículo
Determining Optimal Population Management with Reinforcement Learning.

Resumen:

Reinforcement learning is a promising artificial maximizes a particular reward by mapping states to actions in a non-deterministic environment, intelligence area which relies on computational simulations where an agent finds a policy that applications in optimization problems. Here, we apply Q-learning, a popular model-free with learning algorithm to a representative ecological problem: the sustainable harvest of a reinforcement which follows a logistic growth rate by modeling it as a valid python gymnasium environment, population contributing to the generation of new environments which represent real-world situations and may lead to decision making. We implemented three different scenarios in which the agents determined an optimal policy guided by different reward signals: a greedy agent, which harvests as much as possible; a conscious agent, which seeks to harvest as much as possible while maintaining high population numbers; and a biocentric agent, which harvests only what is needed to avoid the population to exceed the carrying capacity of the environment. By initializing the population size to 100, with a growth rate of 1 and a carrying capacity of 200, the biocentric agent had the largest accumulated harvest, suggesting that a sustainable strategy is more profitable in the long term. Reinforcement learning is a very promising approach for decision making in many ecological real-world situations, where population management is a very straightforward application.

  • Cita: Garcilita-Arguello, S., Roman-Rangel, E. (2025). Determining Optimal Population Management with Reinforcement Learning. In: López-Monroy, A.P., Rosales-Pérez, A., Carrasco-Ochoa, J.A., Martínez-Trinidad, J.F., Olvera-López, J.A. (eds) Pattern Recognition. MCPR 2025. Lecture Notes in Computer Science, vol 15715. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-031-96255-4_29.
Gráfica presentada en el artículo
Mapping causal networks from theories of change in sustainability projects: a software co-design process

Resumen:

Envisioning trajectories towards sustainability encompasses enacting significant changes in multiple spheres (i.e., infrastructure, policy, practices, behaviors). These changes unfold within the intricate landscapes of wicked problems, where diverse perspectives and potential solutions intersect and often clash. Advancing more equitable and sustainable trajectories demands recognition of and collaboration with diverse voices to uncover meaningful synergies among groups striving to catalyze substantial change. Projects of this nature necessitate the exploration of varied tools and methodologies to elicit, convey, and integrate ideas effectively. Creating spaces for reflexivity is essential for catalyzing more meaningful impact as individuals engage in discussions aimed at sharing and questioning the coherence of their projects while forging synergies, identifying common objectives, and planning long-term outcomes. We present the initial phase of an endeavor in which we developed a software that elicits causal networks based on mapping relations between projects’ actions and outcomes. To illustrate our approach, we describe the results of using this software within collaborative workshops with groups spearheading projects initiated by a government entity in Mexico City. By adapting elements of the Theory of Change model, this software transcends the dominant linear project logic by guiding participants in designing causation networks that unveil how different projects can articulate to identify potential common elements and find new possibilities for coordination among initiatives. We discuss the potential of such software application as a dynamic tool to guide and promote reflection and coherence when crafting projects that aim to more meaningfully address sustainability problems.

  • Cita: García Meneses, Paola & Garcia-Herrera, Rodrigo & Serrano-Candela, Fidel & Charli-Joseph, Lakshmi & Mota-Nieto, Jazmin & Mejía-Ciro, Juan & Platas-Valle, Elisa & Garcilita Argüello, Salvador & Fernández-Reyes, Adrian & Cruz, A. (2024). Mapping causal networks from theories of change in sustainability projects: a software co-design process. Frontiers in Sustainability. 5. 10.3389/frsus.2024.1405501.
Gráfica presentada en el artículo
Tracing impact through intersectoral nets

Resumen: Artículo de opinión sobre el concepto de impacto y su relación con proyectos de cooperación y desarrollo.

  • Cita: Garcilita, S. (2023). Tracing impact through intersectoral nets. In: Plataforma Mexicana de Captura y Almacenamiento de CO₂ (2023). Gaceta Punto Crítico No.5 (mayo-junio 2023) / Newsletter Punto Crítico No.5 (May-June 2023) (0.0.1).
Portada del reporte
Modelo de base de datos relacional para el monitoreo y toma de decisiones en Áreas Naturales Protegidas

Resumen:

El presente documento (y sus archivos anexados) es un esfuerzo para generar una base de datos para la Dirección Regional Centro y Eje Neovolcánico (DRCEN) de la Comisión Nacional de Áreas Naturales Protegidas (CONANP) en México. El resultado, es una propuesta de una base de datos relacional2 mantenible en el tiempo que sirva para sustentar una toma de decisiones efectiva basada en datos y evidencia, así como para la generación de insumos como podrían ser reportes, tableros (dashboards), gráficos, etc. Realizado por Salvador Garcilita (fundador de bioalgoritmia) cuando fungía como asesor en la cooperación alemana para el desarrollo (GIZ).

  • Cita: Garcilita, S. (2022). Modelo de base de datos relacional para el monitoreo y toma de decisiones en áreas naturales protegidas. Deutsche Gesellschaft für Internationale Zusammenarbeit (GIZ) GmbH.